全区植被基本分为山地和谷地植被两大类别，山地植被为阔叶红松林，谷地植被为冷、云杉和毛赤杨林及河岸柳丛。但随着海拔高度、坡向、坡位、坡度和土壤水分条件的变化，森林类型也呈现出明显的变化规律。

保护区的地带性植被是以红松为主的温带针阔叶混交林。区内既有从未采伐过的原始林，也有经火烧或皆伐后发生的次生林，有森林发生演替的各个阶段，同时还有人工营造的红松、云杉、落叶松、樟子松人工林及不同混交方式的人工混交林。按一般植被分类的原则和方法，全区植被可划分为寒温性针叶林、温性针阔叶混交林、落叶阔叶林、灌丛、草甸、沼泽等6大植被类型11个群系19个群丛。

凉水自然保护区的植被分类系统 表3-1

Ⅰ.寒温性针叶林

1.兴安落叶松林(Larix gmelini Form.)

(1)草类兴安落叶松林(Lerbosa-Larix gmelini Ass.)

2.红皮云杉林(Picea koraieasis Form.)

(2)臭冷杉红皮云杉林(Abies nephrolepis-picea koraiensis Ass.)

3.臭冷杉林(Abies nephrolepis Form.)

(3)红皮云杉臭冷杉林(Picea koraiensis-Abies nephrolepis Ass.)

(4)臭冷杉林(Abies nephrolepis Ass.)

Ⅱ.温性针阔叶混交林

4.红松针阔叶混交林(Pinus koraiensis Form.)

(5)鱼鳞云杉红松林(Picea jezoensis-Pinus koraiensis Ass.)

(6)柞树红松林(Qurcus mongolica-Pinus koraiensis Ass.)

(7)椴树红松林(Tilia amurensis-Pinus koraiensis Ass.)

(8)枫桦红松林(Betula costata-Pinus koraiensis Ass.)

(9)红皮云杉红松林(Picea koraiensis-Pinus koraiensis Ass.)

Ⅲ.落叶阔叶林

5.山杨林(Populus davidiana Form.)

(10)山杨林(Populus davidiana Ass.)

(11)白桦山杨林(Betula platyphylla-Populus davidiana Ass.)

6.白桦林(Betula platyphylia Form.)

(12)白桦林(Betula platypylla Ass.)

(13)山杨白桦林(Populus davidiana-Betula platyphyila Ass.)

7.水曲柳核桃楸榆树林(Fraxinus mandshurica-Juglans mandshurica-Ulmus propinqua Form.)

(14)水曲柳核桃楸榆树林(Fraxinus mandshurica-Juglans mandshurica-Ulmus propinqua Ass.)

8.毛赤杨林(Alnus hirsuta Form.)

(15)毛赤杨林(Alnus hirsuta Ass.)

Ⅳ.灌丛

9.落叶阔叶灌丛

(16)绢柳、细柱柳、粉枝柳灌丛(Salix viminalis-S.gracilistyla-S.rorida Ass.)

Ⅴ.草甸

10.杂草类草甸

(17)小叶章杂草类草甸(Deyeuxia angustifolia-Herbosa Ass.)

Ⅵ.沼泽

11.修氏苔草沼泽(Carex shcmidtii Form.)

(18)小叶章修氏苔草沼泽(Deyeuxia angustifolia-Carex schmidtii Ass.)

(19)丛桦北极悬钩子修氏苔草沼泽(Betula-Rbus arcticus-Carex schmidtii Ass.)

森林是保护区生态环境和自然资源的主体，森林资源是保护区生物资源的基础和核心。保护区总面积12133km2，森林活立木总蓄积量为188.23万m3。